當前，我國智慧農業依然處在相對早期的發展階段，大量硬件投入還未完全解決農業的根本問題，智慧農業還面臨以下困難和問題。

智慧農業“有面子，缺里子”。智慧農業設施裝備價格較高，由于未納入財政購置補貼范疇，農戶難以承受價格成本。不少地方發展智慧農業還停留在“面子工程”，大屏幕隨處可見，實際意義卻不大。核心技術研發還有待進一步加強，傳感器國產化、精確度、集成度、抗逆性都不高，動植物本體傳感器基本處于空白，尚未研發出專用智能芯片，也尚未構建起動植物生長模型。

智慧農業“有數據，缺智慧”。信息孤島和重復建設較為普遍，信息數據資源共享機制不健全，全國性和全產業鏈數據共享平臺仍未建立，政務數據、行業數據、社會數據、企業數據難以有效匯聚融合和合理利用。涉農信息服務多以在線查詢為主，由于缺少針對農業大數據的深度挖掘、分析和利用，在預測預警和優化資源配置等核心功能方面的作用還遠未發揮。

智慧農業“有盆景，缺風景”。近年來，隨著“互聯網+”行動的深入實施，各地探索創造了有特色的智慧農業“盆景”，但還未形成有效可推廣的“風景”。特別是衛星定位、地理信息、遙感、現代通信技術等技術融合集成度低，相關裝備的易操作性差、價格高，不少地方智慧農業建設存在“增量不增效”、“種產銷”脫節、技術應用脫離實際生產等問題，限制了智慧農業的推廣應用。

智慧農業“有技術，缺人才”。農村勞動力文化水平普遍偏低，農業勞動強度大，年輕人不愿意從事農業，年長的農業從業者在思想觀念上陳舊落后、互聯網應用技術也較為落后，相對于數字化、智能化的新興產物接受能力較差，嚴重阻礙了智慧農業的傳播與發展。加上農村在經濟、醫療以及教育等方面與城鎮存在較大差異，很難讓與智慧農業發展相符合的新型人才引得進、留得下、用得好。